麝鼠的最佳引种时期是每年的九月至翌年的四月份。麝鼠抗寒能力强，但不耐高温，在25℃以上的气温长途运送种鼠，会使麝鼠产生较强的应激反应，死亡率高。九月份以后天气逐渐凉爽，当年产下的仔鼠经5-6个月的饲养已逐渐长大，正是引种的好时机。由于，麝鼠的笼舍是用砖头水泥砌成的，九月份以后秋高气爽也有利于笼舍的建造。
装运种鼠可以用汽车、火车或飞机，如果运输路途当天可以到达的可以用汽车，长途运送最好用火车，超长距离运送可用飞机空运。
装运种鼠的笼具最好用16号丝网做成的运输笼，运笼可分隔成8-10个小隔间，每个隔间装一只种鼠，这样可防止多只种鼠混装在一起而引起种鼠间互相撕打，造成大量伤亡。装笼时要注意公母鼠的搭配，把不同血缘，体形毛色相近的公母鼠靠近配对装笼，这样经过运输过程中公母鼠相互嗅吻、熟悉，到达目的地后就可以顺利地配对饲养了。必须注意，运送种鼠不能用麻袋等软包装装运种鼠。
装运前必须装备充足新鲜的饲料，运笼要用细铁丝扎牢，装运前仔细检查，防止麝鼠在运输途中逃走。还应备好手套、铁丝、钳子、水壶、电筒等。启运前要让麝鼠进行充分的水浴，喂饱后再运输。在运输途中给水时要防止麝鼠毛绒被淋湿，只从头部淋滴少许即可。
运笼上车、下车要轻提轻放，抬的时候要将笼子提起，严禁拖拉运笼，防止拖伤或折断麝鼠的腿部。运输途中严禁他人逗弄或惊扰，谢绝参观，不要在闹市或人多的地方逗留。运送途中一要有专人管理、押运，随时注意观察，发现异常现象，立即采取相应措施。
麝鼠在整个的运送过程中，由于原来的生活地点环境发生改变，在运输途中的颠波惊吓，麝鼠会产生某些应激性反应，所以到达目的地后可投喂维生素E，适当补充硒，也可以大量补给维生素C以缓解应激反应。要加强营养，麝鼠产生应激反应后对营养的需求量加大，特别对蛋白质、矿物质、维生素的需求量提高，在保证投给新鲜的适口性好的绿色植物的同时，适当补给动物性饲料和乳、豆制品是十分必要的，在饲料中添加VC、VE、VA有利于提高抗应激的能力。
